濕地生態(tài)系統(tǒng)
        用自然生物處理水產養(yǎng)殖水體主要有濕地、穩(wěn)定塘和土地處理系統(tǒng)等，其優(yōu)點是處理含氮和磷的水體，能達到比較徹底的處理效果。
        人工濕地具有一定的污水處理能力，對氮、磷有機物懸浮物等的去除有良好的效果，人工濕地凈化工農業(yè)已有大量研究，近年來，用人工濕地處理水產養(yǎng)殖取得一定進展。非集約化水產養(yǎng)殖的自然水域本身是一個典型濕地系統(tǒng)，具有良好的自凈能力，只要合理利用和加強其自凈能力，會有良好的環(huán)境效應和經濟效應;Kruzie等綜合土地處理\濕地\池塘\水生植物系統(tǒng)進行水產養(yǎng)殖水體循環(huán)。Wood等利用人工濕地系統(tǒng)處理水體，濕地系統(tǒng)中藻類密度高，在地表水利負荷13.5cm/d時，COD的去除率59.2%、NH+4-N為34.6%、PO-4-P-為31.9%和SS為78%;如果水力停留時間在3 d，則COD的去除率79.4%、NH+4-N為82.8%、PO3-4-P為54.1%、蛋白質產率50 t/hm2.a。Lin等[27]用人工濕地處理水產養(yǎng)殖水體，在水力負荷為1.8~13.5 cm/d之間，則NH+4-N去除率為86%~98%，總無機氮(TIN)為95%~98%，磷的去除為32%~71%，出水NH+4-N濃度< 0.3 mg/L，NO-2-N< 0.01 mg/L。對于鹽度高的水體，用耐鹽性植物種植在沙性濕地上，可去除養(yǎng)殖水體中98%的總氮、94%的無機氮、99%的總磷和97%的溶解態(tài)磷。
        魚塘水生生態(tài)系統(tǒng)
        魚塘水生生態(tài)系統(tǒng)本身有很強的凈污能力，在水產養(yǎng)殖水體的處理中完全可以利用魚塘對污染物的凈化能力來凈化污水。養(yǎng)殖水體的綜合利用主要是用池塘的自凈能力和魚類生理特性，如充氧、魚藻共生系統(tǒng)、魚類白天和晚上不同活動時間混養(yǎng)、耐污能力不同魚類混養(yǎng)和對魚類生理修正。Kirke從曝氣方面進行了研究，對魚塘采用風力曝氣;Logsdon從改變水生植物結構著手，利用浮萍對氮和磷的吸收(1 km2的浮萍能吸收約802 kg氮和146kg的磷)和對重金屬的累積能力處理水產養(yǎng)殖水體。Wang用雙殼類去除藻類，沉降法去除懸浮物，通過蝦塘、蠔形成水的循環(huán)利用。Umble等用魚塘處理污水二級處理出水，利用二級處理出水提供的營養(yǎng)，調節(jié)營養(yǎng)比例(N∶P在16~23)，使得水生植物繁殖，作為魚類的食料。養(yǎng)殖水體的綜合利用的安全是人們關心的問題，Adamsson等進行的研究結果表明，只要投加飼料成分恰當，影響不大，但從保守的觀點來說，有待于進一步證實。