黑臭水體治理雖然國家有統(tǒng)一要求，但不同的地方、不同的發(fā)展階段，有不同的治理需求。就太湖流域來說，當前要系統(tǒng)治理黑臭水體，從工業(yè)、生活、農(nóng)業(yè)和生態(tài)修復等方面，應著重做好以下工作。

工業(yè)污染防治抓兩頭，即提檔升級和淘汰落后。一是全面開展企業(yè)資源集約利用綜合評價工作，制定出臺差別化生態(tài)環(huán)境保護政策。排序靠前的企業(yè)推行環(huán)保領跑者制度，鼓勵污染物排放濃度和總量超低排放，排序靠后的企業(yè)實施改造或退出措施，合理、優(yōu)質(zhì)、高效配置要素資源，全面淘汰低端低效產(chǎn)能，堅決關停高耗能、高排放和“散亂污”企業(yè)。二是全面開展重點行業(yè)提標改造，加強工業(yè)園區(qū)升級治理。按照太湖流域最新出臺的重點行業(yè)及城鎮(zhèn)污水處理廠排放限值要求，按期完成六大重點行業(yè)和工業(yè)園區(qū)污水處理廠提標改造。開展園區(qū)雨污分流改造、企業(yè)廢水分類收集，所有省級以上開發(fā)區(qū)開展園區(qū)循環(huán)化改造，加快建設國家或省級生態(tài)工業(yè)園區(qū)。

城鎮(zhèn)生活污染治理抓達標，即提標改造和提質(zhì)增效。一是嚴格執(zhí)行城鎮(zhèn)污水處理廠排放限值，全面完成城鎮(zhèn)污水處理廠提標改造。流域內(nèi)200多家污水處理廠要制定一廠一策方案，從工程提標和管理提標等多角度推進工作。二是全面開展管網(wǎng)建設改造和排水達標區(qū)建設，加快推進城鎮(zhèn)污水全收集、全處理、全達標。全面開展市政管網(wǎng)及附屬設施普查和檢測，實施雨污混接點、管網(wǎng)漏損點改造，加快城鎮(zhèn)生活小區(qū)、城中村、建制鎮(zhèn)、撤并鄉(xiāng)鎮(zhèn)、工業(yè)集聚區(qū)等排水達標區(qū)建設，將包括小餐飲、洗浴、洗車、洗衣、農(nóng)貿(mào)市場等各類生產(chǎn)生活污水全部納入排水達標區(qū)管理范疇，實現(xiàn)提質(zhì)增效。

農(nóng)業(yè)面源污染防治抓減量，即種養(yǎng)結(jié)合和循環(huán)利用。一是推進生態(tài)循環(huán)農(nóng)業(yè)建設，實現(xiàn)化肥農(nóng)藥減施。鼓勵種植和養(yǎng)殖結(jié)合，在農(nóng)業(yè)園區(qū)、規(guī)模種植基地和丘陵山區(qū)大力推廣農(nóng)牧結(jié)合、種養(yǎng)循環(huán)等生態(tài)農(nóng)業(yè)模式。以太湖一、二級保護區(qū)為重點實施耕地輪作休耕，實現(xiàn)流域內(nèi)化肥農(nóng)藥大規(guī)模減施。二是加強養(yǎng)殖污染治理，推進循環(huán)利用。加快推進畜禽生態(tài)健康養(yǎng)殖，配套完善畜禽養(yǎng)殖廢棄物處理和資源化利用設施，在有條件的養(yǎng)殖密集區(qū)建設畜禽糞污專業(yè)化收運體系和集中處理資源化利用中心，大幅度提高流域畜禽糞污綜合利用率。加快實施養(yǎng)殖池塘生態(tài)化改造，促進池塘養(yǎng)殖尾水達標排放或循環(huán)利用。

河道生態(tài)修復抓系統(tǒng)，即水質(zhì)改善和生態(tài)鏈構(gòu)建并重。一是在截污控源的基礎上，在流域有條件的河流、湖蕩，因地制宜建設和修復濕地，進一步改善水質(zhì)。鼓勵太湖一級保護區(qū)和上游重點地區(qū)城鎮(zhèn)污水處理廠創(chuàng)造條件將尾水接入人工濕地或自然濕地等，實現(xiàn)尾水生態(tài)凈化。二是注重系統(tǒng)思維，重視生態(tài)系統(tǒng)整體構(gòu)建。綜合考慮多種因素，包括雨水收集利用、防洪護坡設計等雨洪管理，包括水系溝通的活水工程、裁彎取直營造自然生境增加生物棲息地等河道改造，包括不同季節(jié)植物的選擇、魚類的搭配等物種和數(shù)量的選擇等。生態(tài)系統(tǒng)整體構(gòu)建應成為今后濕地建設關注的重點。